Matthias Ginter a rejoint le centre de formation fribourgeois dès l'adolescence, a évolué dans toutes les équipes de jeunes du SC et a remporté la coupe d'Allemagne des moins de 19 ans en 2011 et 2012. En janvier 2012, Ginter a fait ses débuts professionnels, à l’âge de 18 ans, et a marqué le but de la victoire (1-0) contre le FC Augsbourg. Au total, le défenseur central a disputé 81 matchs avec l’équipe première.

En juillet 2014, il signe au Borussia Dortmund. Sous les couleurs du BVB, il a disputé 102 matchs officiels et a remporté la Coupe d'Allemagne en 2017. De 2017 à aujourd'hui, il a pris part à 178 rencontres avec le Borussia Mönchengladbach.

Alors qu'il était encore au Sport-Club, Matthias Ginter a fait ses débuts avec l'équipe nationale allemande en 2014, étant le plus jeune membre de l'équipe championne du monde au Brésil. Il a jusqu’à présent porté à 46 reprises le maillot de la Mannschaft. Aux côtés de Nils Petersen, il a remporté en 2016 la médaille d'argent avec l'équipe olympique de football à Rio de Janeiro.

« Le contact avec Matze n'a jamais été rompu et son lien avec sa région d'origine a toujours été présent, tant sur le plan géographique que sportif », a expliqué le directeur sportif Klemens Hartenbach. « Nous connaissons bien sûr parfaitement les qualités de Matze, mais nous aborderons cette collaboration avec des attentes saines et réalistes. Matze peut apporter de la stabilité à notre défense et, grâce à ses qualités de footballeur, nous faire du bien dans la construction du jeu. Avec Matze, nous souhaitons aborder les grands défis de la saison à venir en tant qu'équipe et en tant que club. »

Matthias Ginter s’est de son côté exprimé : « Je voulais faire encore une fois quelque chose de très spécial dans ma carrière et il n'y a rien de plus spécial pour moi que de revenir au Sport-Club, chez moi. Le développement de l'ensemble du club, le potentiel de l'équipe ainsi que la manière particulière d'échanger avec les responsables du club au cours des dernières semaines - trouver tout cela dans ma région natale peut être considéré comme un privilège par les temps qui courent. Tout a simplement été parfait. »

Matthias Ginter portera le maillot numéro 28. Les termes du contrat sont tenus secrets.